גנומיקה

גנומיקה היא ענף של גנטיקה שעוסק בגנום, מכלול החומר התורשתי של יצור חי. המונח נגזר מהמילה "גנום". התחום צמח בסוף שנות ה-80 עם התפתחות טכנולוגיות מיפוי וריצוף DNA, ועם ריצוף גנומים שלמים.

הולדת הגנומיקה הובילה להתפתחות מדעי-אומיקה (omics), שעוסקים במכלולים אחרים בתא. פרוטאומיקה חוקרת את כל החלבונים בתא. טרנסקריפטומיקה חוקרת את ה-mRNA, העתק ה-RNA שנוצר מה-DNA.

נכון ל-2011 רוצפו גנומים של כ-2,719 נגיפים, 1,115 חיידקים וכ-36 איקריוטים, כשכמחצית מהאיקריוטים הם פטריות. גנומיקה כוללת ניתוח חישובי, סטטיסטי ופונקציונלי של רצף ה-DNA. היא מנצלת ביו-אינפורמטיקה, כלים ומחשבים לניתוח נתונים גנומיים. בעזרת תוכנות ניתן לחזות תפקידים רבים של גנים לפני ניסויים במעבדה.

בחקר מחפשים מוטיבים, מגמות ומאפיינים ייחודיים ברצף. בוחנים אזורים כמו אקסונים (חלקים שמקודדים לחלבון), אינטרונים (רצפים לא מקודדים) ורצפים חוזרים וקדמיים.

בתחומי המשנה של הגנומיקה: גנומיקה השוואתית משווה בין גנים אורתולוגיים כדי להסביר הבדלים אבולוציוניים. גנומיקה פונקציונלית בודקת שינויים בביטוי גנים, הייצור של RNA וחלבון, בתגובה לתנאים שונים, ומקורה בשימוש במערכי DNA. גנומיקת נוף חוקרת איך תנאים סביבתיים משפיעים על הגנום.

גנומיקה בוחנת את הגנום. הגנום הוא כל ה-DNA של יצור חי. המילה גנומיקה באה מהמילה גנום. התחום התחיל בסוף שנות ה-80 כשיָכלו לקרוא את ה-DNA.

נולדו גם מדעים דומים שנקראים אומיקה. פרוטאומיקה בודקת את כל החלבונים בתא. טרנסקריפטומיקה בודקת את ה-mRNA, העתק קצר מה-DNA.

עד 2011 רוצפו גנומים של 2,719 נגיפים, 1,115 חיידקים וכ-36 יצורים עם תאים גרעיניים. כ-חצי מהאחרונים הם פטריות.

חוקרים משתמשים במחשבים כדי לנתח רצפי DNA. המחשבים עוזרים למצוא תבניות ולנחש מה כל גן עושה. יש גם ענפים כמו גנומיקה השוואתית, שמשווה גנים בין יצורים, וגנומיקה פונקציונלית, שבודקת איך ביטוי הגנים משתנה בתנאים שונים. גנומיקת נוף בודקת איך הסביבה משפיעה על הגנום.