תנועת הרוח הקדושה הוקמה בראשות אליס אומה. אליס הייתה מדיום, אישה שטוענת שהיא מקבלת הדרכה רוחנית, וטענה שהרוח לקוונה הורתה לה להקים את התנועה באוגוסט 1986.
רשמית הייתה הבחנה בין הזרוע הפוליטית של אליס ושמה תנועת הרוח הקדושה, לבין "הכוח הנייד של הרוח הקדושה" כזרוע צבאית. בפועל לא הייתה הפרדה ממשית ביניהן. בנובמבר 1986 הצליחה אליס לשכנע חלק מהצבא הדמוקרטי של אזרחי אוגנדה להעביר חיילים תחת פיקודה. בנובמבר, דצמבר 1986 השיגה התנועה שני ניצחונות לא צפויים, וכך הרחיבה תמיכת שבט האצ'ולי ושבטים צפוניים אחרים.
התנועה נודעה בכך שלא התעללה בחייליה, בניגוד לכוחות אחרים, ומשיכה זו חיזקה את תמיכתה הציבורית. בצורת הלחימה שלה היו מרכיבים רוחניים בולטים: "שליטים" רוחניים בכל יחידה; שטיפת שמן מבורך (שמן שמאמינים שהוא מגן מפגיעה); ברכת אבנים שאמורות להתפוצץ; וחיילים שצעדו בתצורת צלב תוך שירת תפילה. כמה שיטות אלה הוכיחו יעילות במצבים מסוימים, אבל לא מנעו הפסדים כבדים מול כוחות מצוידים במקלעים.
יחסים עם הצבא הדמוקרטי התערערו בתחילת 1987, ובאוגוסט אותה שנה פתחה התנועה במבצע גדול שמטרתו לכבוש את קמפלה ולהקים, כפי שאליס קראה, "גן-עדן עלי אדמות". בנובמבר 1987 התקדמו כוחות התנועה לאזורים ללא תמיכה והובסו בקרב שבו נעשה שימוש בנשק ארטילרי כבד, כלומר תותחים ונשק כבד, ביער כ-70 ק"מ צפונית לקמפלה.
לאחר התפרקותה הפכו חלק מהשאריות לחבורות שודדים, שרובן התפרקו מאוחר יותר. עם זאת, קבוצה אחת המשיכה ופיתחה את עצמה לצבא ההתנגדות של האל, שפועל עד היום באזור אצ'ולילנד.
אליס אומה הנהיגה את תנועת הרוח הקדושה. אליס הייתה מדיום. מדיום זו אישה שאומרת שהיא שומעת רוח שמנחה אותה. היא אמרה שהרוח לקוונה הורתה לה להקים את הארגון באוגוסט 1986.
היא קיבצה סביביה מאמינים וחיילים מחלק מהצבא הדמוקרטי של אזרחי אוגנדה. בנובמבר ודצמבר 1986 זכתה התנועה בשתי הצלחות שלא ציפו להן. ההצלחות גרמו לאנשים מהאצ'ולי ושבטים צפוניים להצטרף.
התנועה הייתה ידועה בכך שהיא לא התעללה בחיילים. זה נתן לה סימפטיה מהציבור. לחיילים היו מנהגים מיוחדים. הם קיבלו שמן מבורך, שרו תפילות וצעדו בתבנית שדומה לצלב. הם האמינו שגם אבנים ברוכות יוכלו לעזור בקרב.
באוגוסט 1987 התנועה יצאה למבצע גדול שנועד לכבוש את קמפלה. בנובמבר אותה שנה הם ניסו להרחיב את הפעילות לאזורים בלי תמיכה. לאחר סדרת הפסדים, הם הובסו בקרב גדול ביער כ-70 ק"מ צפונית לקמפלה. שם נעשה שימוש בנשק ארטילרי. נשק ארטילרי זה הוא תותחים או נשק כבד.
לאחר מכן רוב התנועה התפרקה. חלק הפכו לשודדים. קבוצת שרדה והפכה לצבא ההתנגדות של האל, שפועל באזור אצ'ולילנד עד היום.
תגובות גולשים