טקסונומיה (מיון עולם הטבע) היא שיטה שמסדרת אורגניזמים בקבוצות על פי מאפיינים משותפים. כל קבוצה נקראת טקסון, והטקסונים מסודרים בהיררכיה (דרגות), דרגות גבוהות מכילות דרגות נמוכות. המונח נובע מיוונית ומשמש מדענים כדי לדבר על יחסים בין מינים.
בעבר סיווגו את היצורים לשתי ממלכות בלבד: צמחים ובעלי חיים. קארולוס ליניאוס (לינאוס) פיתח ב־1735 את השיטה ההיררכית והמינוח הדו-שמי לשמות מינים. עם הזמן התגלו יצורים שלא התאימו לשתי הממלכות, והתווספו קבוצות נוספות.
ליניאוס הציע היררכיה ברורה: ממלכה, מערכה (Phylum), מחלקה (Class), סדרה (Order), משפחה (Family), סוג (Genus) ומין (Species). מין הוא היחידה הבסיסית, קבוצה של פרטים שיכולים להתרבות זה עם זה. טקסונומים מוסיפים לעתים תגיות כמו על- ומטה- (על-ממלכה, תת-מערכה) לדרגות ביניים.
מאוחר יותר התברר שהמיון ההיררכי משקף גם היסטוריה אבולוציונית. עבודותיו של דרווין הראו שהקשרים בין קבוצות נגרמים מתהליך התפתחות משותף. לכן כיום הטקסונומיה מתבססת לא רק על צורה חיצונית, אלא גם על יחסים אבולוציוניים.
בעידן המודרני משתמשים בכלים כמו פילוגנטיקה (שחוקרת עצי יחס אבולוציוניים) וקלדיסטיקה. שיטות גנטיות, למשל ניתוח rRNA, הובילו להבחנה בשלוש על-ממלכות (דומיינים): חיידקים אמיתיים (Bacteria), חיידקים קדומים (Archaea) ואאוקריוטים (Eukaryota).
כיום שיטות המיון מבוססות בעיקר על דמיון גנטי ולא רק על מראה חיצוני. לדוגמה, במערכת הצמחים השפיעו שיטות ישנות כמו קרונקויסט (1981), ואחר כך קבוצת APG פרסמה מיון עדכני ב־1998 ובעקבותיו עדכונים ב־2003 וב־2009. שינויים כאלה מקשים על יצירת סיווג סופי.
הסיווג מבוסס על מאפיינים משותפים והיסטוריה אבולוציונית. טקסונומיה שואפת לקבץ סוגים שקשרים ביניהם הם אמיתיים, לא רק דמיון חיצוני.
הטקסונומיה מסייעת להבין את המגוון הביולוגי, לארגן מידע ולתקשר בין מדענים.
אתגרים כוללים שינויים בגלל מידע גנטי חדש והצורך להחליט היכן למקם יצורים שקשה לשייך.
טקסונומיה היא דרך לארגן את כל היצורים בטבע. טקסון הוא קבוצה של ארגונים דומים. סדר היררכי אומר שקבוצה גדולה כוללת קבוצות קטנות יותר.
קארולוס ליניאוס רשם את השמות של חיות וצמחים ב־1735. הוא חילק את היצורים לדרגות כמו ממלכה, משפחה, סוג ומין. מין זה קבוצה של פרטים שיכולים להתרבות זה עם זה.
מדענים היום בודקים גם DNA, החומר התורשתי, כדי לדעת מי קרוב למי. בדקו מולקולות rRNA ומצאו שלוש על-ממלכות גדולות: חיידקים אמיתיים, חיידקים קדומים ואאוקריוטים (יצורים עם גרעין).
הטקסונומיה עוזרת לנו להבין את המגוון בטבע ולדעת איך יצורים קשורים זה לזה.